TED tem prazo até o fim do dia mesmo. Normalmente é quase instantâneo, mas esse problema que você descreveu não acontece só com o Nubank. Comigo já aconteceu de “bancão” para “bancão” (se não me engano, de Santander para Itaú).
Sobre sua pergunta, ainda tenho um pé atrás com bancos novos, especialmente depois daquela “oscilação” onde o Nubank emitiu comprovantes de pagamento de boletos sem ter repassado os valores ao banco cedente.
Imagino que os bancos tradicionais, por estarem na ativa há mais tempo, têm um sistema muito mais robusto. Mas eu acho que isso tende a melhorar para as fintechs com a chegada do PIX.